パンダゲノム - 蝉コロン

中国が次世代シーケンサーを大量購入しているのが話題になりましたが（幻影随想: 北京ゲノムセンター（BGI）が新型シーケンサーを128台新規に購入するそうな ）、開戦（何の？）の狼煙を上げるようにパンダゲノムを解読したぞという論文が報告されていました。Nature紹介記事http://www.nature.com/nature/journal/v463/n7279/standfirst/463303a_ja.html 使ったのはIllumina Genome Analyser。古き良きサンガー法と比べると、次世代シーケンサーは配列を読むDNAをすごく小さな断片にするので、得られた生データをつなぎあわせて再構築する必要があります。ヒトゲノムとかなら参照できる配列がすでにあるので問題ないのですが、パンダは今回初めて全体像が明らかになるので、その再構築が大変になることが予想されます。それをどのよう

[akirahs]

参照配列がなくても次世代シーケンサーの短い配列データからゲノムを解読できるというのは良いね。

[blackshadow]

確か解読完了は去年の12月だったか。パンダゲノムの解読計画自体は2007年の中国人ゲノム解読が終わった頃に既に予定されていたので、意外と時間がかかった印象

[y-mat2006]

まあ、絶滅しかけてる生き物には、確かにそれなりの理由があるみたい。（身体は肉食なのに草食だから）インテリジェンスな造物主が存在するのなら、そいつはきっとひどいサディストに違いない。

[GuriGura]

勉強になりました／ただパンダグラフについて皆さんが注意深く言及を避けているのは何か申し合わせのようなものがあったのでしょうか？

[quix_que]

パンダが笹を食べたときの消化吸収率は猫が猫草食べたときと同程度、っていうのは昔読んだブルーバックスに書いてあった。