新型コロナウイルスSARS-CoV-2のゲノム分子疫学調査（2020年10月26日現在）

新型コロナウイルス・ゲノム分子疫学解析によるクラスター対策 2019年末に中国・武漢で初めて確認された新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）は、2020年１月に国内で初めて感染者が確認された。その後、現在まで地域的な感染クラスター（集団）とその集合体である複数回の感染ピークを生じている。自治体では積極的疫学調査を実施し、クラスターの発生源の特定と濃厚接触者の追跡によって感染拡大を封じ込める対策を行ってきた。この活動を支援すべく、我々は、SARS-CoV-2（一本鎖プラス鎖RNAウイルス、全長29.9 kb）のゲノム配列を確定し、感染クラスターに特有な遺伝子情報およびクラスター間の共通性を解析している。これまでに2回にわたってゲノム情報が示す国内伝播の状況を概説してきた（2020年4月27日1）、2020年8月6日2））。また、日本国内3,4）、ダイヤモンド・プリセンス号の乗員乗客5）、

[koyhoge]

10月末までの国内SARS-CoV-2のゲノム解析。現在流行しているのは2つの親を株とする2群のゲノムクラスター。

[nunux]

現在、国内で検出されるSARS-CoV-2は、元を辿れば2つの系統に由来すると推定されている。3～4月・欧州系統の中心クラスターから300を超えるクラスター系統へ分岐・派生したものの、この2系統のみ残し他はすべて消失してい

[noho-sibe]

バイアリータークはもう…

[lastline]

やはり、3月の時点で出入国を制限すべきだったなぁ

[khwarizmi]

ミトコンドリア・イブのようなすごい話だな。残った2系統にそれぞれ由来するホストクラブの店名とかつけれないのかね…

[tokage3]

7月以降の検体は全て2つの系統から派生したものと。これひょっとしたら、5月〜6月の東京を強制的に抑え込んでいたら勝ってたんじゃないの？開国後の外来種の広がりは見られないと。

[zu2]

“同一のゲノム情報をもつSARS-CoV-2であっても、ヒト側の持つ重症化リスク等を考慮に入れる必要があり、ゲノム変異だけを根拠に病原性（または重症度への寄与）を説明することは困難である”

[remcat]

サンプリングの情報すらほとんど書いてないんだけど、こういう報告が許されちゃう分野なんですね、と。