ニューヨーク州の新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）基本再生産数R₀を推定してみたら、やはり破滅的だった

リクエストがあったので、ニューヨーク州（半分以上は市）のデータから、東京都の推定などに使ったのと同じ推定モデル、同じパラメーター暗数7割と回復率γを仮定して*1、(a)3月1日から4月4日までの1ヶ月ちょっと、(b)3月1日からの1週間、(c)4月4日までの1週間の3種類のR₀の推定と、最後の(c)のR₀（に従うβ）をパラメーターにとる4/4からのSIRモデルによる予測を描いてみた。 まずは、(a)3月1日から4月4日までの1ヶ月ちょっとだが、指数分布に従わないプロットになっている事が分かる。初期の急増に対して慌て、次々にうった感染防止策がある程度機能していることを意味する。なお、感染から発症までが5日間、重症化するまで7日間と言われるので、横軸の日付の12日ぐらい前の状況を見ている。

[arajin]

「ロックダウン後の一週間は直近の東京（R₀=2.8）よりもマシ」「ピーク時は州民の23%が同時に罹患し、最終的には州民の9割が感染を経験するので、十分低いR₀ではない。」

[mohno]

そもそもニューヨークは感染した→即日判明した数字、なんてことはなくて、ようやく検査体制が整っただけなんだよな。だから、割と「急に検査体制が整いったようす」をあらわしてるだけなんだよね、このグラフ。