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RNAの検索結果41 - 80 件 / 112件

  • RNAはDNAとどう違うのか?

    DNAとRNAの違い RNAは遺伝情報であるDNAから転写されてできるものである。実際はそれだけではないが、ここではそのようなRNAに限定して話を進める。DNAとの違いはぱっと見はあまりないように見えるが、以下の2つの違いが挙げられる。 分子組成が違う まず、そもそもDNAとRNAでは糖の部分の元素組成が違う。糖の2’位に付いているのが水素(-H)ではなく、ヒドロキシ基(-OH)である。 たった原子1個分の違い?と思うかもしれないが、これが分子の安定性に非常に大きな差を生み出す。反応性の高い孤立電子対を2つ持つヒドロキシ基がもともとある3’位に加えて2’位にも存在することになる。このヒドロキシ基はホスホジエステル結合を求核攻撃し、切断してしまう。 これが、「RNAは分解されやすい」と言われる理由の1つである。 DNAの「遺伝情報の保存」と異なり、RNAはタンパク質への情報の橋渡しを担う。そ

      RNAはDNAとどう違うのか?
    • 【scRNA-seq】single cell RNA-seqデータを公共データから探す方法【バイオインフォマティクス】 - LabCode

      scRNA-seqとは? scRNA-seq (single-cell RNA sequencing)は、個々の細胞内の遺伝子発現パターンを研究するために使用される方法です。これにより、細胞集団内の個々の細胞での遺伝子発現を分析することができます。細胞の識別、細胞のライフサイクル、細胞の発生などに用いられることが多い手法です。 Stephanie Hicks Welcome to the World of Single-Cell RNA-Sequencing https://speakerdeck.com/stephaniehicks/welcome-to-the-world-of-single-cell-rna-sequencing?slide=3 scRNA-seq解析をするときの言語はRとPythonどちらを選ぶか Single cell RNA-seq解析には、PythonとRの両

        【scRNA-seq】single cell RNA-seqデータを公共データから探す方法【バイオインフォマティクス】 - LabCode
      • Amazon.co.jp: RNA-Seqデータ解析 WETラボのための鉄板レシピ (実験医学別冊): 坊農秀雅: 本

          Amazon.co.jp: RNA-Seqデータ解析 WETラボのための鉄板レシピ (実験医学別冊): 坊農秀雅: 本
        • 【バイオインフォマティクス】R言語でRNA−seqデータの主成分分析する方法【PCA】 - LabCode

          主成分分析(PCA)とは? 主成分分析とは、多次元データを低次元に次元圧縮する手法の一つです。主成分分析は、データの性質を最もよく表す要素を抽出することができるため、データの可視化やクラスタリングなどの機械学習手法を用いた分析にも活用されます。 RNA-seq解析では、主成分分析を使用することで、大量の発現データをより簡単かつ高速に解析することができます。主成分分析は、原発現データの次元圧縮を行い、主な発現変動のパターンを抽出します。これにより、大量の発現データを分かりやすく視覚化し、その結果をもとに遺伝子の発現変動や発現パターンを解析することができます。 Rを実行する準備 今回はRstudioを使ってRを実行していきます。 各OS環境を元にこちらのサイトよりインストーラーをダウンロードしてください。 https://cran.r-project.org/ インストールするバージョンは最新

            【バイオインフォマティクス】R言語でRNA−seqデータの主成分分析する方法【PCA】 - LabCode
          • コロナワクチン接種、改造RNAが体内に残り、自己免疫疾患を起こす懸念

            「厚生労働省 HP」より 新型コロナウイルスのワクチン接種が国内でも始まっています。テレビでは、接種直後に起こる「副反応」の話題が折々報じられますが、その都度、「まれなことなので心配はいらない」との専門家によるコメントも一緒に紹介されるなど、不自然さも隠さず国を挙げて安全性が強調されています。 そもそも副反応とは何なのでしょうか? 従来のワクチンは、病原体の一部を注射で体の中に入れ、それに対する免疫反応、つまり抗体ができることを期待したものです。免疫反応は注射した部位に起こるものですから、そこが赤くはれたり、痛くなったりするのは期待どおりの出来事であり、これらを副反応と呼ぶのは間違っています。 医療行為にともなう出来事には「効果」と「副作用」の2つしかありません。国民に恐怖心を呼び起こさせないよう意図的に「副作用」という言葉を避け、「副反応」を使っているだけではないでしょうか。 では、本当

              コロナワクチン接種、改造RNAが体内に残り、自己免疫疾患を起こす懸念
            • Suppression of RNA recognition by Toll-like receptors: the impact of nucleoside modification and the evolutionary origin of RNA - PubMed

              The .gov means it’s official. Federal government websites often end in .gov or .mil. Before sharing sensitive information, make sure you’re on a federal government site. The site is secure. The https:// ensures that you are connecting to the official website and that any information you provide is encrypted and transmitted securely.

                Suppression of RNA recognition by Toll-like receptors: the impact of nucleoside modification and the evolutionary origin of RNA - PubMed
              • 須藤玲司 on Twitter: "【科学】中華人民共和国総領事館、RNAたんを美少女めがねっこ擬人化したうえで、コロナウイルスたんに百合百合と騙され眼鏡を外されるピンチを描く。 https://t.co/Dtp93iFJRn"

                【科学】中華人民共和国総領事館、RNAたんを美少女めがねっこ擬人化したうえで、コロナウイルスたんに百合百合と騙され眼鏡を外されるピンチを描く。 https://t.co/Dtp93iFJRn

                  須藤玲司 on Twitter: "【科学】中華人民共和国総領事館、RNAたんを美少女めがねっこ擬人化したうえで、コロナウイルスたんに百合百合と騙され眼鏡を外されるピンチを描く。 https://t.co/Dtp93iFJRn"
                • コロナで注目のRNAワクチン 日本人研究者の45年前の発見が礎に「こんな形で利用されるとは…」:東京新聞 TOKYO Web

                  新型コロナウイルスの変異株が広がる中、引き続きワクチンの高い効果が示されている。このワクチンの開発に、日本人研究者の1970年代の発見が大きな役割を果たしている。ワクチンが体内で働くのに不可欠な「キャップ」という物質だ。発見者の分子生物学者、古市泰宏さん(80)は「当時は、こんな形で利用されるようになるとは考えもしなかった」と話す。(森耕一) 6月下旬、古市さんは自宅のある神奈川県鎌倉市内の体育館でワクチン接種を受けた。順番を待つ大勢の人を見て「こんなにたくさんの人の体に、私の発見が入っていくのか」と喜びを感じたという。

                    コロナで注目のRNAワクチン 日本人研究者の45年前の発見が礎に「こんな形で利用されるとは…」:東京新聞 TOKYO Web
                  • イカは自分の伝令RNAを編集し複数のタンパク質を生み出すというスーパースキルを持っていることが判明(米研究) : カラパイア

                    頭足類類は知れば知るほど魅力的な生き物だ。非常に高い知能を備え、しかも食べて美味しいイカに、驚愕の能力が発見されたそうだ。 それは自分の遺伝情報を編集するというスーパースキルで、一つの種類のmRNAから複数の種類のタンパク質を作り出せるのだそうだ。これを利用すれば遺伝性の難病の治療にも役立つかもしれないという。

                      イカは自分の伝令RNAを編集し複数のタンパク質を生み出すというスーパースキルを持っていることが判明(米研究) : カラパイア
                    • 【解決】DNAとRNAの構造や性質の違い

                      1.DNAとRNAの構造 ○DNAとRNAの基本単位「ヌクレオチド」 DNA(デオキシリボ核酸)とRNA(リボ核酸)は、ともに核酸と呼ばれ、塩基、糖およびリン酸からなる「ヌクレオチド」が連なった構造をしています。下図は、DNAとRNAのヌクレオチドの構造になります。 ※塩基における炭素原子の番号と区別するため、糖には番号に「’」(プライム)をつけます。 DNAの塩基には、A(アデニン)、G(グアニン)、C(シトシン)、T(チミン)が用いられますが、RNAの塩基には、Tの代わりにU(ウラシル)が用いられます。 A(アデニン)とG(グアニン)はプリン塩基と呼ばれ、C(シトシン)とT(チミン)はピリミジン塩基と呼ばれています。プリン塩基とピリミジン塩基は、それぞれプリン環とピリミジン環をもつことに由来しています。 ※塩基は、AとT(水素結合2個)、GとC(水素結合3個)の間で相補的に結合する性質

                      • mRNA(メッセンジャーRNA)ワクチンやウイルスベクターワクチンは新しい仕組みのワクチンということですが、どこが既存のワクチンと違うのですか。|Q&A|新型コロナワクチンQ&A|厚生労働省

                        mRNA(メッセンジャーRNA)ワクチンやウイルスベクターワクチンは新しい仕組みのワクチンということですが、どこが既存のワクチンと違うのですか。 mRNA(メッセンジャーRNA)ワクチンやウイルスベクターワクチンは新しい仕組みのワクチンということですが、どこが既存のワクチンと違うのですか。 ウイルスのタンパク質をつくるもとになる遺伝情報の一部を注射します。体内で産生されるウイルスのタンパク質に対する抗体などが体内で作られることにより、ウイルスに対する免疫ができます。 これまで我が国において使用されていたワクチン(不活化ワクチン、組換えタンパクワクチン、ペプチドワクチン)はウイルスの一部のタンパク質を人体に投与し、それに対して免疫が出来る仕組みでした。 mRNA(メッセンジャーRNA)ワクチンやウイルスベクターワクチンでは、ウイルスのタンパク質をつくるもとになる遺伝情報の一部を注射します。人

                          mRNA(メッセンジャーRNA)ワクチンやウイルスベクターワクチンは新しい仕組みのワクチンということですが、どこが既存のワクチンと違うのですか。|Q&A|新型コロナワクチンQ&A|厚生労働省
                        • 【バイオインフォマティクス】CellBenderでSingle Cell RNA-seqデータのノイズ除去を行う【scRNA-seq】 - LabCode

                          scRNA-seqデータはクオリティコントロール(QC)をすると聞いたことがあるかもしれませんが詳しく理解ができていない人もいるのではないでしょうか。 ここではSingle Cell RNA-seqサンプルをCellBenderを使ってノイズを除去する方法を学びます。 これまで漠然としていたscRNA-seqのクオリティコントロールについてわかるようになります。ぜひ挑戦してみましょう。 CellBenderとは? CellBenderには解説ページが用意されているので、今回はこちらをもとに解説していきます。 CellBenderとは、scRNA-seqデータにしばしば存在する実験的なノイズやアーチファクト(背景ノイズ、ドロップアウト、空のドロプレットなど)を処理するためのソフトウェアです。 空のドロプレットの識別:ドロップシーケンシングでは、細胞がキャプチャされなかったドロプレットでもRN

                          • 「RNA農薬」で病原菌克服 名古屋大、感染の仕組み解明 - 日本経済新聞

                            NIKKEI Primeについて 朝夕刊や電子版ではお伝えしきれない情報をお届けします。今後も様々な切り口でサービスを開始予定です。

                              「RNA農薬」で病原菌克服 名古屋大、感染の仕組み解明 - 日本経済新聞
                            • 「死の誕生」が生物の起源?……自己増殖マシーン「RNA」が「壊れる」ことで全てが始まった!(小林 武彦)

                              すべての生物に共通である「死」。 つまり、生物の進化の最初から「死」はインプットされていたことになる。 ベストセラー『生物はなぜ死ぬのか』の著者である小林武彦氏が「死の起源」を探る! (本記事は小林武彦『なぜヒトだけが老いるのか』から抜粋・編集したものです。) 「よどみ」に生まれた生命のタネ「RNA」 一番最初の生物を作った進化とは、いったいいかなるものだったのでしょうか。これは、コンピュータにたとえると「プログラム」のようなものです。プログラムは、簡単に言うと規則です。たとえば「AとBを足して平均をCとする、それを繰り返す」みたいなものです。 進化のプログラムの最初は、単純な「物質」からのスタートです。地球上の生命は38億年前に熱水が噴き出し、温度が高く化学物質が常に供給されるような比較的小さな「よどみ」で起こったと考えられています。このような場所は化学反応が起こりやすいのです。生き物は

                                「死の誕生」が生物の起源?……自己増殖マシーン「RNA」が「壊れる」ことで全てが始まった!(小林 武彦)
                              • ホルミシス効果の獲得と継承を担う小分子RNA

                                理化学研究所(理研)生命機能科学研究センター老化分子生物学研究チームの岡部恵美子リサーチアソシエイト、宇野雅晴研究員、西田栄介チームリーダーらの研究チームは、マイルドな環境ストレスにより誘導される個体のストレス耐性(ホルミシス効果[1])が、小分子RNA(small RNA)[2]による組織間コミュニケーションを介して子孫へ継承されることを発見しました。 本研究成果は、親が経験した環境情報を次世代に伝えることで子孫の生存能力を高める、という生物の生存戦略の一つについての新たな知見となります。 生物は常にさまざまな環境ストレスにさらされています。過度なストレスは生物に悪影響を与えますが、マイルドなストレスを経験した個体はしばしばストレス耐性を獲得することが知られており、これは「ホルミシス効果」と呼ばれます。特に線虫[3]では、ホルミシス効果は世代を超えて継承されることが観察されています。 今

                                  ホルミシス効果の獲得と継承を担う小分子RNA
                                • 新型コロナワクチン(M-RNAワクチン)はどのようなワクチンですか?何が怖いのでしょうか?

                                  新型コロナワクチン(M-RNAワクチン)はどのようなワクチンですか? 何が怖いのでしょうか? 新型コロナのワクチンはなんだか怖い…と思われる方も多いと思いますが、「何が」「どう」怖いのか!!? そもそもどんなワクチンなのか!? そんな質問が多くみられます。今回はそのワクチンについて調べてみました。 その前の知識として、ワクチンとはどういうものか!? を説明します。私たちの身体には『免疫』と呼ばれる「自分とは違う物質」が体内に侵入してくると、攻撃しやっつけてくれる機能があります。(詳細はQ&Aブログ{免疫とウイルス対策}をご参照ください)菌やウイルスが体内に入ってくると、この免疫機能によって「直接攻撃(細胞性免疫)」と「抗体による攻撃(液性免疫)」を行いますが、抗体による攻撃は、一度も体内に侵入したことのない物に対しては、対応する抗体を探し出す&作る作業に時間が(長いと3日くらい)かかってし

                                  • GitHub - NAalytics/Assemblies-of-putative-SARS-CoV2-spike-encoding-mRNA-sequences-for-vaccines-BNT-162b2-and-mRNA-1273: RNA vaccines have become a key tool in moving forward through the challenges raised both in the current pandemic and in numerous other

                                    ##version 0.21Beta 04/14/21: (updates intended to (i) clarify the clinical and research importance of sequence information and strand topology measurements, and (ii) clarify that the mRNA sequence is not a recipe to produce vaccine)## Dae-Eun Jeong, Matthew McCoy, Karen Artiles, Orkan Ilbay, Andrew Fire*, Kari Nadeau, Helen Park, Brooke Betts, Scott Boyd, Ramona Hoh, and Massa Shoura* Departments

                                      GitHub - NAalytics/Assemblies-of-putative-SARS-CoV2-spike-encoding-mRNA-sequences-for-vaccines-BNT-162b2-and-mRNA-1273: RNA vaccines have become a key tool in moving forward through the challenges raised both in the current pandemic and in numerous other
                                    • 【やじうまPC Watch】 生命起源の鍵?自己複製できる最小のRNAを早稲田大/東大が発見

                                        【やじうまPC Watch】 生命起源の鍵?自己複製できる最小のRNAを早稲田大/東大が発見
                                      • 【RNA-seq】RNA-seq解析に必要なRの知識(データフレーム編)【R】 - LabCode

                                        R言語とは? R言語は、統計分析やグラフ作成などのために開発されたプログラミング言語です。統計学や生物学向けに大量のパッケージが存在しております。R言語は文法が簡潔であり、グラフ作成の機能が強力なことが特徴です。また、他の言語とのインターフェイスも提供されており、大規模なデータ処理やモデリングを行うこともできます。 またRはRNA-seq解析においても利用されます。RNA-seq解析パッケージを利用すると、遺伝子発現量の比較、差分発現解析、GO領域やKEGGパスウェイ分析などが簡単に行えるようになっています。また、可視化機能も豊富で、発現量のヒストグラムや発現量の比較などをグラフとして出力することもできます。 Rstudioの設定 Rを実行するにははじめに環境構築が必要となります。今回はRを実行する環境としてRstudioを使っていきます。 各OS環境を元にこちらのサイトよりインストーラー

                                          【RNA-seq】RNA-seq解析に必要なRの知識(データフレーム編)【R】 - LabCode
                                        • 【やってみた】RNAを常温で放置してみた

                                          はじめに RNAは分解しやすいもの。みなさまそんなイメージをお持ちの方がほとんどではないでしょうか。一般的な対策として、RNAの分解を抑えるためには氷上で操作することが推奨されています。しかし実際のところ、どのくらいの熱で分解してしまうのか、気になりませんか?そして実験結果にどのくらい影響してしまうのでしょうか? 弊社で開催しているRNA抽出/cDNA合成ハンズオントレーニングご参加者のそんな率直な疑問から、RNAを常温で放置して、あるいはあえて加熱してどれくらい分解するのかやってみました! 材料と方法 材料: ・RNAサンプル(HeLa細胞からInvitrogen™ PureLink™ RNA mini kitで精製したtotal RNA 5ng/μL) ・Applied Biosystems™ TaqMan™ Fast Virus 1-Step Master Mix ・Applied

                                            【やってみた】RNAを常温で放置してみた
                                          • 未知の微生物が発見されたかもしれない研究をみて2014年に同じテーマで「みなしごRNA」と題して応募したが「存在しなかったらどうする?」と落とされた話

                                            GIGAZINE(ギガジン) @gigazine 科学者が「正気の沙汰じゃない」と口走る新発見、人体から発見されたウイルスでもバクテリアでもない謎の生物的存在「オベリスク」とは? gigazine.net/news/20240207-… 2024-02-07 06:00:20 リンク GIGAZINE 科学者が「正気の沙汰じゃない」と口走る新発見、人体から発見されたウイルスでもバクテリアでもない謎の生物的存在「オベリスク」とは? 腸内細菌などのバクテリアとは違って、ウイルスは独自に増殖することができず代謝もしないことから、長年にわたり生物か非生物か議論の的になっています。そんなウイルスよりもさらに小さく単純ながら、これまで発見されているものとは明らかに異なることから、新しく「オベリスク」との名称が与えられた存在の発見についての論文が発表され、科学界から大きな注目を集めています。 230 u

                                              未知の微生物が発見されたかもしれない研究をみて2014年に同じテーマで「みなしごRNA」と題して応募したが「存在しなかったらどうする?」と落とされた話
                                            • 史上初、絶滅種のRNA抽出に成功! - ナゾロジー

                                              絶滅したタスマニアタイガーの復活は近いかもしれません。 スウェーデン・ストックホルム大学(Stockholm University)はこのほど、約130年前のタスマニアタイガーの標本からRNAを抽出し、配列の解読に成功したと発表しました。 RNAは、設計図であるDNA情報をもとに身体の組織を作る上で欠かせない存在です。 また絶滅動物からRNAが抽出されたのは史上初めての成果となります。 研究の詳細は、2023年9月19日付で科学雑誌『Genome Research』に掲載されました。 RNA for the first time recovered from an extinct species https://www.su.se/english/news/rna-for-the-first-time-recovered-from-an-extinct-species-1.675743 R

                                                史上初、絶滅種のRNA抽出に成功! - ナゾロジー
                                              • 【RNA-seq】RNA-seq解析に必要なRの知識(ggplot編)【R】 - LabCode

                                                作画ツールggplotとは? ggplotは、R言語において美しく柔軟なグラフを描画するためのパッケージです。各種グラフのタイプ(散布図、ヒストグラム、箱ひげ図など)もggplotを使用することで描画することができます。生命科学において、RNA-seq解析の結果を視覚化するために使用されます。RNA-seq解析によって得られた遺伝子発現量のデータを可視化することで、遺伝子の発現パターンを理解することができます。美しく柔軟なグラフを簡単に描画することができるのでR言語を使う醍醐味だと考える人も多いです。 Rstudioの設定 R環境の用意 Rを実行するにははじめに環境構築が必要となります。今回はRを実行する環境としてRstudioを使っていきます。 各OS環境を元にこちらのサイトよりインストーラーをダウンロードしてください。https://cran.r-project.org/ インストール

                                                  【RNA-seq】RNA-seq解析に必要なRの知識(ggplot編)【R】 - LabCode
                                                • [終末的特報]マサチューセッツ工科大学の研究者たちが「新型コロナウイルスの RNA がヒトDNA に統合される」ことを完全に突き止める。全米科学アカデミー紀要に査読済み論文として発表 - In Deep

                                                  2021年からの世界 人類の未来 健康の真実 日本の未来 [終末的特報]マサチューセッツ工科大学の研究者たちが「新型コロナウイルスの RNA がヒトDNA に統合される」ことを完全に突き止める。全米科学アカデミー紀要に査読済み論文として発表 childrenshealthdefense.org 新型コロナウイルス RNA が遺伝子に組み込まれることは確定か 今年 1月の以下の記事で、アメリカの研究者たちが、 「新型コロナウイルスの RNA は逆転写されヒトゲノムに組み込まれる」 という論文を発表したことをご紹介しました。 地球は巨大な実験場に : 米スタンフォード大学から発表された「コロナウイルスのRNAは逆転写されヒトゲノムに組み込まれる」ことから思う「mRNAワクチンが遺伝子を改変する可能性」に思うこと 投稿日:2021年1月25日 この研究発表は大変に物議を醸しました。 なぜなら、現

                                                  • RNAコロナワクチンは細胞内で逆転写される: current issues in molecular biologyに掲載された論文から|荒川央 (あらかわ ひろし)

                                                    RNAコロナワクチンは細胞内で逆転写される: current issues in molecular biologyに掲載された論文から コロナワクチンに使われているスパイクタンパクは血管毒性を持ち、肺や心臓、脳にも障害を起こす事があります。スパイクタンパクは血流を循環し、さらにエクソソーム上のスパイクタンパクは4ヶ月以上も全身を巡る事が報告されています。RNAコロナワクチンは1-メチル-シュードウリジンで修飾されており、簡単には分解されません。しかし、なぜスパイクタンパクが数ヶ月以上も体内に残るのか、あるいはスパイクタンパクの生産が体内で続くのか等、疑問は多く残っています。 以前、細胞株内でコロナウイルスが逆転写されゲノムに組み込まれるという内容の論文を紹介しました。その論文内で解析されたものはコロナウイルスのRNAゲノムについてでしたが、今回紹介するのは内在性のLINE-1によってRN

                                                      RNAコロナワクチンは細胞内で逆転写される: current issues in molecular biologyに掲載された論文から|荒川央 (あらかわ ひろし)
                                                    • m-RNAワクチンの説明 | 白石クリニック

                                                      このワクチンは大変巧妙に設計されていて、効果が高く、また、副作用がほとんど見られないことが特徴です。数十年後どのような副作用が出るかはわかりませんが、現時点では妊婦や小児以外の方は数十年後もおそらくほとんど問題ないと言っていいかと思います。特に60歳以上の方は数十年後の、あるかないかわからない副作用を恐れるより、明日の命を重視したほうがいいのではないかと考えております。 ワクチンについてもう少し詳しく説明します。普段、細胞は核の中のDNAから情報(設計図)をコピーして同じ細胞内にあるリボゾームというたんぱく生産工場にその設計図を送りそこでたんぱく質を作って体に提供します。そのコピー(設計図)がmRNA(メッセンジャーアールエヌエー)なのです。もちろんこの設計図には印をつけて人間のものである認証をしているのでリボゾームも安心してたんぱくを作れています。使われた設計図は細胞内で自然に壊されてい

                                                      • RNA | MBL Life Sience -ASIA-

                                                        RNAはDNAと同じ核酸で、ヌクレオチドと呼ばれるリン酸・塩基・糖から成る基本構造を持ち、ヌクレオチドが連なった構造(ポリヌクレオチド)をとります。RNAは、転写により一部のDNA配列を鋳型として合成されます。DNAとRNAの違いは3つあります。まず、一本鎖のポリヌクレオチドであることです。二番目は、糖の種類です。RNAの糖(リボース)は、酸素分子がDNAの糖(デオキシリボース)より一つ多いことです。三番目は塩基の種類です。DNAの塩基はA、T、G、Cですが、RNAはTのかわりにUになります。 RNAは、翻訳されるかどうかで大きく2種類に分けられます。翻訳を受けるRNAからは、タンパク質が合成されます。DNAからタンパク質をコードする配列をコピーして、タンパク質合成を担うリボソームまでDNAの遺伝情報を運ぶ役目を持つメッセンジャーRNA(mRNA)がこれに相当します。 一方、タンパク質をコ

                                                        • 研究者「」@1copyからのRT-PCR on Twitter: "今日は休みだったので予備実験をちょっと10000、1000、100、10copyのRNAをPCRして検量線を書いてみた。結果Cq値は10000copyが26.43、1000copyが29.86、100copyが33.23、10co… https://t.co/Wok91YgKmm"

                                                          今日は休みだったので予備実験をちょっと10000、1000、100、10copyのRNAをPCRして検量線を書いてみた。結果Cq値は10000copyが26.43、1000copyが29.86、100copyが33.23、10co… https://t.co/Wok91YgKmm

                                                            研究者「」@1copyからのRT-PCR on Twitter: "今日は休みだったので予備実験をちょっと10000、1000、100、10copyのRNAをPCRして検量線を書いてみた。結果Cq値は10000copyが26.43、1000copyが29.86、100copyが33.23、10co… https://t.co/Wok91YgKmm"
                                                          • 絶滅種のRNA抽出に初成功、タスマニアンタイガー復活の取り組みに期待

                                                            130年前のタスマニアンタイガーの標本から組織サンプルが採取されRNAの解読に成功した/Emilio Mármol Sánchez (CNN) スウェーデンの研究チームが、絶滅したタスマニアンタイガーの標本からRNAを抽出し、解読することに初めて成功したとして、19日の科学誌ゲノム・リサーチに論文を発表した。 RNAはストックホルムのスウェーデン自然史博物館が収蔵している130年前のタスマニアンタイガーの標本から採取された。研究チームはタスマニアンタイガーの遺伝子機能解明に役立つとして期待を寄せる。 「RNAは、細胞や組織を調べてタスマニアンタイガーが死ぬ直前に保全されていた真の生態を発見できるチャンスを与えてくれる」と研究者は解説する。 タスマニアンタイガーは有袋類の肉食動物で、オーストラリアのタスマニア島を除いて2000年ほど前に世界から姿を消した。タスマニア島でも欧州からの入植者によ

                                                              絶滅種のRNA抽出に初成功、タスマニアンタイガー復活の取り組みに期待
                                                            • 【Windows】Windowsでikraを使ってRNA-seq解析【RNA-seq解析】 - LabCode

                                                              RNA-seqを用いた全ゲノム解析のやり方を知りたいと思いませんか? RNA−seq解析はドライ系のバイオインフォマティシャンの人だけがやるんでしょ..?と考えている実験系の人は多いかもしれませんが、近年はRNA−seq解析の敷居が下がり、実験系の人でも取り入れることが可能になってきております。 前回はMac向けのikraの使い方を書きましたが、実際の多くの研究者はWindowsを使っていると思いますので、今回はLinuxのディストリビューションであるUbuntuを入れることで、Windowsでもikraを動かす方法を紹介したいと思います。 デバイス名 K-DELL プロセッサ 12th Gen Intel(R) Core(TM) i5-1240P 1.70 GHz 実装 RAM 8.00 GB システムの種類 64 ビット オペレーティング システム、x64 ベース プロセッサ

                                                                【Windows】Windowsでikraを使ってRNA-seq解析【RNA-seq解析】 - LabCode
                                                              • 挙げられてる条例は保守的な道徳観に基づくもので女性の人権を根拠にした規制じゃないんだがなぁ… - rna のブックマーク / はてなブックマーク

                                                                こちらの広告の件、【千代田区の生活環境条例の第14条】に違反していると、千代田区より正式な回答がありました。また「掲出店舗に対し、環境まちづくり総務課や所轄警察者などと連携を図りながら指導を行ってま... 257 人がブックマーク・150 件のコメント

                                                                  挙げられてる条例は保守的な道徳観に基づくもので女性の人権を根拠にした規制じゃないんだがなぁ… - rna のブックマーク / はてなブックマーク
                                                                • "遺伝"するRNAーーエピジェネティクな変化は世代を超えるのか?(中屋敷 均)

                                                                  第二次世界大戦末期に起こった深刻な食糧危機。この「オランダ飢餓」とも呼ばれる危機の影響による病的な形質が、子世代はおろか、孫世代にまで"遺伝"している可能性があることについて、前回の記事でご紹介した。 遺伝子には、ヒストン修飾やDNAのメチル化などによって、その発現が制御されていることがわかっていたが、ある個体が得たエピジェネティクな変化は生殖細胞へと伝えられることはなく、子孫には伝わらないというのが従来の理解だった。 母体が「オランダ飢餓」から影響を受けた子供や孫に現れた病的な形質は、エピジェネティクな変化によるものなのか? 「エピジェティクな情報の子孫への遺伝」について、引き続き、考察してみたい。 前回:"遺伝"するRNAーー孫世代まで引き継がれた「オランダ飢餓」の記憶(https://gendai.ismedia.jp/articles/-/95790) 世代を超える記憶 さて、話を

                                                                    "遺伝"するRNAーーエピジェネティクな変化は世代を超えるのか?(中屋敷 均)
                                                                  • 生命の起源に飛躍的な発見!高校生の実験レベルでRNAが合成

                                                                    DNAの類似物で、生物の最初の遺伝物質であると考えられているリボ核酸(RNA)が玄武岩質溶岩ガラス上で自然発生的に形成されることを、応用分子進化学研究所の研究者たちが発表しました。このようなガラスは、43億5千万年前の地球上には豊富にありました。似たような太古の生き残りである玄武岩は、火星上にもあります。 「生命の起源を研究しているコミュニティは、近年、分裂してきています。」と語るのは、「Astrobiology」に掲載された論文の共著者である、スティーブン・ベンナー氏です。「あるコミュニティは、熟練した化学者によって成し遂げられるような難しい化学反応を要する、古典的で複雑な化学反応へと立ち返っています。彼らの美しい手工細工は、NatureやScienceといった有名な科学誌で発表されています。」しかし、これらの化学反応が複雑であるのは明らかで、地球上で生命が実際にどのように現れたのかを説

                                                                      生命の起源に飛躍的な発見!高校生の実験レベルでRNAが合成
                                                                    • 地球は巨大な実験場に : 米スタンフォード大学から発表された「コロナウイルスのRNAは逆転写されヒトゲノムに組み込まれる」ことから思う「mRNAワクチンが遺伝子を改変する可能性」に思うこと - In Deep

                                                                      2021年からの世界 ディストピアへようこそ 人類の未来 健康の真実 地球は巨大な実験場に : 米スタンフォード大学から発表された「コロナウイルスのRNAは逆転写されヒトゲノムに組み込まれる」ことから思う「mRNAワクチンが遺伝子を改変する可能性」に思うこと outsourcing-pharma.com 次々と mRNA ベースのワクチンが開発されていく中で コロナの mRNA ワクチンの開発も手がけたバイオテクノロジー企業のモデルナが、最近、「季節性インフルエンザの mRNA ワクチンの開発に着手した」というプレスリリースを発表していました。 以下はそれに関してのアメリカのニュースです。 モデルナが、季節性インフルエンザ、HIV、ニパウイルスのmRNAワクチン開発を発表 メッセンジャーRNA(mRNA)治療薬とワクチンのパイオニアであるバイオテクノロジー企業モデルナが、これまでの感染症ワ

                                                                      • 孫正義もやらないし自分で自宅で新型コロナ検査をしよう(2)ウイルスRNAの逆転写とPCR。研究試薬個人輸入時のコツ /バイオハッカー・ジャパン

                                                                        ツイート 2020.03.30 孫正義もやらないし自分で自宅で新型コロナ検査をしよう(2)ウイルスRNAの逆転写とPCR。研究試薬個人輸入時のコツ ↑今回購入した新型コロナウイルスを見分ける「プライマーDNA」4種類と添付文章。4本で23ドル+送料。 GWに実家に帰省するので、帰省前に自分で家族全員の陰性を確認してから帰る計画。医療機関はやってくれないからね。ウイルスフリーの鳥取に住む両親を危険に晒すわけにはいかないからね。 前回↓の続き。やり方の大雑把な説明です ◆◆◆新型コロナウイルスのRT-PCR分析の5ステップ模式図◆◆◆ (3)cDNAへの逆転写(RT) 鼻水などから抽出した「RNA」とは遺伝子(核酸)の一種ですが、人類の発明した遺伝子増幅技術「PCR(ポリメラーゼ・チェーン・リアクション)」を行うにはRNAと相補的(A-T,G-Cの対になる)なDNAに変換する必要があります。細

                                                                          孫正義もやらないし自分で自宅で新型コロナ検査をしよう(2)ウイルスRNAの逆転写とPCR。研究試薬個人輸入時のコツ /バイオハッカー・ジャパン
                                                                        • mRNAワクチン(メッセンジャーRNAワクチン) | Chem-Station (ケムステ)

                                                                          chemglossary mRNAワクチン(メッセンジャーRNAワクチン) 2021/1/25 chemglossary, 医薬化学, 生化学 mRNA, ワクチン コメント: 0 投稿者: kanako 病原体のタンパクをコードしたmRNAをベースとしたワクチン。従来のワクチンは、弱毒化・不活化した病原体そのものや、病原体のタンパクや多糖を用いる一方で、mRNAワクチンでは病原体タンパクの遺伝子をヒトの体内へと送り込み、ヒトの細胞内で病原体タンパクを作らせる。送り込んだmRNAや作られた病原体タンパクによって免疫を活性化させることができる。 1. 一般的なワクチンの種類 一般的に使われているワクチンには、大きく分けて生ワクチンと不活化ワクチンの2種類がある(図1)。 生ワクチン(弱毒化ワクチン;live-attenuated vaccine) 不活化ワクチン(inactivated va

                                                                          • 【バイオインフォマティクス】ikraを用いたメタ解析のやり方【RNA-seq】 - LabCode

                                                                            RNA-seq解析の手法の一つにメタ解析と呼ばれる手法があることを聞いたことがありますでしょうか。メタ解析はNGSを持っている研究室だけができる研究手法でしょ?と思っている人もいるかも知れませんが、最近は公共データを大量に解析することで、データを再活用することも注目されています。 この記事では、RNA-seq解析自動化パイプラインであるikraを用いて、論文で使われているようなメタ解析の手法をご紹介したいと思います。解析の時間はかかりますが、難しくありません。メタ解析にはいろいろなやり方がありますが、今回はikraと相性のよいメタ解析のやり方を紹介します。 メタ解析を学べば、それだけで論文が書けてしまうほど強力な手法になります。ぜひ身につけていきましょう!

                                                                              【バイオインフォマティクス】ikraを用いたメタ解析のやり方【RNA-seq】 - LabCode
                                                                            • 国産の純度の高いメッセンジャーRNAワクチン(mRNA)の研究開発について - ラクラクブログ rakuraku.com

                                                                              名古屋大などの研究で、ワクチン成分のmRNA純度99%で副作用の少ないワクチン開発進む 名古屋大学などの研究で今月11日、新型コロナウイルスワクチンなどの成分になる「メッセンジャーRNA(mRNA)」を99%以上の高純度で製造する技術を開発したと発表しました。 純度が高まることで発熱などの副作用の抑制も期待できるということです。 設立したスタートアップを通じて、国産のmRNA製造技術として実用化を目指しています。 名古屋大と東京医科歯科大学の研究成果で、英科学誌ネイチャー・コミュニケーションズにも掲載されました。 mRNAワクチンはウイルスの目印となる、たんぱく質の設計図が入ったmRNAを投与し、 体内で目印のたんぱく質が合成されて、ウイルスへの免疫をつけます。 ワクチンとして機能させるために鎖状のmRNA分子の端に、たんぱく質の合成に必要で炎症反応を抑える役割がある「キャップ」と呼ばれる

                                                                                国産の純度の高いメッセンジャーRNAワクチン(mRNA)の研究開発について - ラクラクブログ rakuraku.com
                                                                              • RNAワクチン - Wikipedia

                                                                                この記事は検証可能性のために医学に関する信頼できる情報源を必要としている、あるいは過度に一次資料に基づいています。 可能なら内容を見直し適切な出典を追加してください。信頼性が乏しい記述は、疑問が呈されたり、除去されることがあります。 出典検索?: "RNAワクチン" – ニュース · 書籍 · スカラー · CiNii · J-STAGE · NDL · dlib.jp · ジャパンサーチ · TWL(2020年12月) RNAワクチン、またはmRNAワクチン(メッセンジャーRNAワクチン)は、メッセンジャーRNA(mRNA)と呼ばれる天然化学物質の人工複製物を使用して免疫反応を起こすワクチンの一種。ワクチンは合成RNAの分子をヒトの細胞に導入し、細胞内に入ると、ワクチンのRNAはmRNAとして機能し、細胞は通常、病原体(ウイルスなど)やがん細胞によって産生されるはずの外来タンパク質を作る

                                                                                • 狙った細胞に「自分を殺す毒」を作らせるRNA技術が登場 - ナゾロジー

                                                                                  がん細胞だけを殺すRNAができるかもしれません。 ハーバード大学とMIT(マサチューセッツ工科大学)で行われた研究によれば、狙った細胞に好きなタンパク質を生産させる特殊なRNA(eToehold)を開発した、とのこと。 がん細胞やウイルスに感染した細胞など特定の細胞に対して、毒となるタンパク質を生産させることができれば、がん治療や感染治療に革命が起こる可能性があります。 しかし、1本鎖の核酸に過ぎないRNAに、どうやって狙った細胞を認識させることができたのでしょうか? 研究内容の詳細は10月28日に『Nature Biotechnology』にて公開されました。 Engineers devise a way to selectively turn on RNA therapies in human cells https://news.mit.edu/2021/rna-therapies-

                                                                                    狙った細胞に「自分を殺す毒」を作らせるRNA技術が登場 - ナゾロジー