タンパク質構造予測・検索は生物学史に新たな章を開いた、かつてのBLASTのように - 殺シ屋鬼司令II

「構造生物学なんもわからん」生物学者でもさわれるのが大事 AlphaFoldの吐く構造をわからんなりにぐりぐりしててわかってきたのは、生物学は完全に新しい章に入った。 thinkeroid.hateblo.jp いきなり大風呂敷広げるやんけ、と思うかもしれないが、こういう状況を私は密かに予見していたというわけではないけど、構造を予測し比較して検索する一連のラインが個人的に欲しい、と思っていた。それがAlphaFoldとその後にでたツールで実現したということだと考えている。 なぜそんなことを考えていたのか？ それは最近、2020年頃までに立て続けに、「配列的な類似性は低い（有意な類似性が見い出せない）が、構造はどう考えても似ている（そして機能的にも非常に似ている）」という研究発表が近い分野で続出したからである。 例えば典型的な例としては2017年にScience誌に掲載された研究だ。 Hol

[synonymous]

生き物を知っていることの価値がますます高まる時代がやってきた。

[zeroset]

今までのように配列だけではなく、立体構造の比較やどんなダイマーが出来るかまで予測できるようになった、と。タンパク質の立体構造は機能と深い関係がある。ワクワクするなあ

[ka-ka_xyz]

ほーん。アミノ酸相同見るのと同じぐらいの感覚で立体構造相同してるやつ（の候補）を見れるようになったと。

[endo_5501]

“その生物学者が、誰でもおうちで簡単タンパク質立体構造セラピーすることができるようになった”

[myr]

wkwkする

[sakstyle]

「実際に立体構造を決めてみるというのは一般の生物学者にとってはおいそれと手を出せる話ではなかった。それがいまや、AlphaFoldとその後の様々なツールの到来で、おうちで簡単タンパク質立体構造予測」