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分子生物学と感染起源に関するnunuxのブックマーク (3)

国内コロナ、欧州起源の第2波か　感染研、武漢の第1波はほぼ終息｜共同通信
国内の新型コロナウイルス感染症は、中国・武漢から持ち込まれた第1波の感染拡大はほぼ終息し、今は欧州で流行しているウイルス株を起源とする第2波が広がっているとする研究結果を、国立感染症研究所が28日までに発表した。感染者から採取したウイルスのゲノム（全遺伝情報）配列のわずかな違いを解析した。中国・武漢で発生したウイルス株は、1～2月に日本に入り込み、各地でクラスターが報告されたが、既に封じ込めたとみられることが分かった。一方で武漢株から変異し欧州で流行しているウイルス株が、3月中旬までに海外からの帰国者らが持ち込む形で国内に流入、拡散したとみられる。
nunux 2020/04/28
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国内のコロナ、武漢ではなく欧州から伝播？　感染研調べ：朝日新聞デジタル
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nunux 2020/04/28
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新型コロナウイルスSARS-CoV-2のゲノム分子疫学調査
国立感染症研究所病原体ゲノム解析研究センター原文PDF版のダウンロード SARS-CoV-2のゲノム上にランダムに発生する変異箇所の足跡をトレースすることにより、感染リンクの過去を遡り積極的疫学調査を支援している。中国発の第１波においては地域固有の感染クラスターが乱立して発生し、“中国、湖北省、武漢”　をキーワードに蓋然性の高い感染者を特定し、濃厚接触者をいち早く探知して抑え込むことができたと推測される。しかしながら、緻密な疫学調査により収束へと導くことができていた矢先、３月中旬から全国各地で “感染リンク不明” の孤発例が同時多発で検出されはじめた。このSARS-CoV-2 ハプロタイプ・ネットワーク図が示すように、渡航自粛が始まる３月中旬までに海外からの帰国者経由（海外旅行者、海外在留邦人）で　“第２波”　の流入を許し、数週間のうちに全国各地へ伝播して “渡航歴なし・リンク不明” の
nunux 2020/04/28
中国発の第１波においては(略)いち早く探知して抑え込むことができたと推測される。３月中旬から全国各地で “第２波”の(略) “渡航歴なし・リンク不明” の患者・無症状病原体保有者が増加したと推測される。

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