ゲーマーの力添えでRNAの高次構造を作る新たなアルゴリズムが誕生した - アレ待チろまん
2014-02-04 ゲーマーの力添えでRNAの高次構造を作る新たなアルゴリズムが誕生した 科学 人間の柔軟な思考と大規模なデータ解析とを融合させると、単にコンピューターだけを使うよりも素晴らしい成果が出せると考えられています。これを研究に適用したのが市民参加型の科学プロジェクトです。これまでに以下のような科学ゲームが研究者によって作られてきました。 タンパク質構造予測ゲーム『fold it』 銀河系ゲーム『Galaxy Zoo』 神経細胞塗り絵ゲーム『EyeWire』 最新のPNAS誌には「科学ゲームのデータから効率よくRNAを設計するアルゴリズムを生み出した」と言う論文が発表されました。 RNA design rules from a massive open laboratory (PNAS, 2014) 研究グループはなぜRNAを折り畳むゲームをわざわざ開発したのでしょうか？またそ
酸浴による体細胞リプログラミング（１月３０日Nature誌掲載論文） | AASJホームページ
メディアはこの話題で持ち切りだ。何人かの知り合いの記者からもコメントを求められた。自分の考えは全て自分のチャンネルを通してだけにしようと決めているので、メディアにコメントするのは全てお断りした。勿論このホームページ(HP)に書いた事を私の意見としてメディアに載せていただく事は、HPの宣伝にもなるので歓迎だ。さて、この論文については私も関係者の一人なので、まずそれを断っておく（神戸理研発生再生研究センター（CDB）に昨年まで在籍、現在も顧問）。意見にバイアスがかかるのを恐れ、これまでCDBの研究を取り挙げる事を控えていた。しかし小保方さんの論文への反響が大きいので、禁を破ってこのHPでも自分の考えを書き残す事にした。 この論文には私も思い出が深い。最初にこの話を聞いたのは仕事でイスラエルに滞在していた約１年半前の事で、メールでの依頼に応じて論文のレフェリーコメントにどう答えればいいのかなどボ
2013年の『科学ブレークスルー・オブ・ザ・イヤー』を10分で理解してみよう - アレ待チろまん
2013-12-21 2013年の『科学ブレークスルー・オブ・ザ・イヤー』を10分で理解してみよう 科学 12月も終わりということで、Science誌に今年を代表する科学研究が特集されています。 Science Breakthrough of the year 2013 そこで簡単な解説文を書いてみました。駆け足ですがお付き合い下さい。 2013年のbreakthrough of the yearはがん免疫療法今年の５月頃に「Ipilimumab (抗CTLA-4抗体薬) とNivolumab (抗PD-1抗体薬) の併用療法により、進行悪性黒色腫患者の約半数で長期間の腫瘍縮小効果が得られた」と言う論文が発表されました。 Nivolumab plus Ipilimumab in Advanced Melanoma (NEJM, 2013) Ipilimumabと抗PD-1抗体薬Nivol
400年生きた貝を一瞬にして殺す
あおやまさんに教えていただいたのですが、400年も生きた貝がイギリスで発見されたのこと。 すごい！ 僕らの大大大先輩ですね。 でも…… 貝は採取時には生きていたが、年齢を調べるために肉をはがしたことで長い生涯を終えた。 動物で最長寿、４００年以上生きた二枚貝を大西洋で発見より： (((;゜Д゜)))(((;゜Д゜)))(((;゜Д゜))) なんてことすんだYo！ (((;゜Д゜)))(((;゜Д゜)))(((;゜Д゜))) そんな貴重な生物を、そんな簡単にサクッと殺しちゃうなんて！ なんで！？ どうしてそんなことが気軽にできちゃうわけ！？ （元ネタ） ごめんね、守ってあげられなくて…… まあここまで思い切りがいいと、逆にリスペクトすらしてしまいそうになります。 大英帝国が世界を支配した理由は、この辺のメンタリティにあるのかもしれないですね。 あるいは、殺すまで年齢は推定すらできず、3歳くら
結核菌、初期人類を追ってアフリカから拡大 研究
患者の腕に出た結核の陽性反応の大きさを測る検査員（2005年6月8日提供、資料写真）。(c)AFP/CDC 【9月2日 AFP】結核（TB）を引き起こす病原菌に関する過去最大規模の遺伝子調査により、結核菌が遅くとも7万年前に初期人類の道筋をたどってアフリカ大陸の外へと拡大したことが分かったとの研究論文が1日、米科学誌ネイチャー・ジェネティクス（Nature Genetics）に発表された。 結核は、最も致死率が高いとされている病気の一つ。治療を施さないと、感染患者の約半数が死に至る。抗生物質の開発が進んだ現在も、発展途上国を中心に毎年100万～200万人の結核患者が死亡している。 スイス熱帯公衆衛生研究所（Swiss Tropical and Public Health Institute）のセバスチャン・ガニュー（Sebastien Gagneux）氏率いる研究チームは、世界中から集めら
SciencePortal | 科学技術の最新情報を提供する総合WEBサイト サイエンスポータル
3月28日 農業は地球の環境悪化の緩和に重要な役割を果たす フランス農学・獣医学・林学研究院 アグリニウム会長 マリオン・ギュー 氏 3月8日 近未来SF漫画で描かれるテクノロジーの未来 漫画家 山田胡瓜さん 12月28日 「世界中の望遠鏡が協力して中性子星合体を観測 ―重力波と光の同時観測『マルチメッセンジャー天文学』の幕開けは、何を意味するのか?」 理化学研究所仁科加速器研究センター 玉川 徹 氏 4月10日 「持続可能な食の未来へ」をテーマに「ノーベル・プライズ・ダイアログ東京2018」開催 世界中からの食の専門家が集結 「科学と社会」推進部 4月2日 《JST主催》「トップサイエンスによる社会変革への挑戦」―JSTの第2回ACCELシンポジウム開催 サイエンスポータル編集部 3月22日 第84回「日本発のデザインバイオロジー確立に向けて」 科学技術振興機構 研究開発戦略センター ラ
シリコンとネズミの心臓組織で作った人工クラゲ
【7月23日 AFP】（一部更新）シリコンポリマーとネズミの心臓の細胞で作られたクラゲのレプリカが、海洋の塩水に似た水の中を「泳ぐ」様子が22日、公開された。バイオミミックリー（Biomimicry、生物模倣）と呼ばれる分野の研究で、筋肉のポンプ作用に関する新たな知見を提供しており、将来的には、心疾患の患者に小型の心臓を提供できるようになる技術へとつながるかもしれない。 生物工学を研究する論文の共同執筆者は、水族館でクラゲの運動を見たときに、心臓のポンプの類似点と相違点に着目したと語る。 このクラゲのレプリカは、ギリシャ神話に登場するヘビの頭髪を持つ怪物メデューサから「メデューソイド（Medusoid）」と名付けられた。 シリコン製のメデューソイドは、8本の足に相当する部分に分かれており、本物のクラゲのもつ筋組織に似せたタンパク質のパターンがコーティングされている。このタンパク質は、ネズミ
恐怖のうちに死んだバッタは怨みを持ち地球環境を破壊するとかしないとか - 蝉コロン
科学, 動物死んだバッタってダイバダッタみたい。死んだバッタの魂宿し。 恐怖の中で死んだバッタ、土壌に悪影響を及ぼす 研究論文 国際ニュース : AFPBB News恐怖におののきながら死んだバッタの死骸は、安らかに死んだバッタの死骸とは異なる影響を土壌に与える――。このような内容の論文が15日発行の米科学誌サイエンス（Science）に発表された。 Science！ホントにあった！Fear of Predation Slows Plant-Litter Decomposition 、捕食の恐怖が落葉の分解を遅らせる！ポエム！ 恐怖の方はいいけど、安らかに死んだかどうかお前に分かるのかよ！！と思ったら片方は普通に飼って、もう片方はクモに食われそうで食われない（クモの口を塞いでいる）状況においたまま飼っているのか。虫かごはアウトドアに置いてるので、基本的にバッタは自然がいっぱいだなあオレは自
リベラル派と保守派、脳構造に違いがあった 英研究
米ワシントンD.C.（Washington, DC）に展示された、民主党のシンボルであるロバと共和党のシンボルであるゾウのオブジェ（2008年8月25日撮影、資料写真）。(c)AFP/Karen BLEIER 【4月9日 AFP】世界観が真っ向から対立することの多いリベラル派と保守派だが、実際、脳の構造が異なっていたとする研究成果が、7日の米科学誌カレント・バイオロジー（Current Biology）に発表された。 英ロンドン大学ユニバーシティー・カレッジ（University College London、UCL）の研究チームは、健康で若い成人90人を対象に実験を行った。自分の政治的志向を1の「非常にリベラル」から5の「非常に保守的」まで5段階で評価してもらったあと、脳をスキャンした。 その結果、リベラル派であるほど前帯状皮質の灰白質の容積が大きく、保守派であるほど右へんとう体の容積が
asahi.com（朝日新聞社）：紅白のエビ・幻の青いケシ 日本人による新種発見相次ぐ - サイエンス
新種と分かったエビ＝採取した山田祐介さん提供新種の青いケシ「ヘテンドラ」＝吉田外司夫さん撮影 日本人による新種の生物の報告が相次いでいる。沖縄では、サンタクロースを連想させる鮮やかな紅白模様のエビが見つかった。中国では、幻の花ともいわれる「青いケシ」の仲間２種が新たに確認された。 エビは全長約１センチで、沖縄本島の浅瀬のほか、１万キロ近く離れたインド洋のマダガスカル島でも発見された。千葉県立中央博物館の駒井智幸さんらが調べたところ、テッポウエビの仲間と分かった。ニュージーランドの学術専門誌に論文が掲載された。 駒井さんは「広い海域に生息しているようだ。サンタのような紅白の体色はよく目立つが、体が小さく、これまで発見されなかったのだろう」と話している。 「青いケシ」は、千葉県在住の植物写真家、吉田外司夫さん（６１）が昨年８月、四川省南西部の標高４千メートルを超す山中で２種、見つけた。
＜速報＞リンの代わりにヒ素をDNA中に取り込む微生物が見つかった - I’m not a scientist.
「NASAが宇宙人を発見か？」と話題になった「宇宙生物学上の画期的な発見」とは，「リンの代わりにヒ素をDNA中に取り込む微生物が見つかった」というものでした． 詳しい解説記事を書く時間はないので，発見のポイントを一枚の画像にまとめてみました．世界的大ニュース（？）に合わせて，久しぶりの更新です． A Bacterium That Can Grow by Using Arsenic Instead of Phosphorus 「リンの代わりにヒ素を使って生育することができる細菌」 Science. Dec. 2, 2010. 発見のインパクト これがなぜ大発見なのか，というと… まずは背景知識． DNAは地球上に存在するほぼ全ての生物が基本的に持っている 遺伝情報を利用し，子孫に伝えるためにDNAが利用されている 生物の大部分は，水素(H)，炭素(C)，窒素(N)，酸素(O)，リン(P)，硫
asahi.com（朝日新聞社）：致死率高い鳥インフル、人間に感染しやすい型に変異 - サイエンス
人に感染すると６割近い致死率を示す高病原性鳥インフルエンザ（Ｈ５Ｎ１）が、インドネシアで豚に感染し、一部が人ののどや鼻の細胞に感染しやすいウイルスに変異したことがわかった。解析した東京大医科学研究所の河岡義裕教授らの研究チームは、致死性の高い新型インフル出現に備え、豚インフルの監視の必要性を強調している。 河岡さんらはインドネシアのアイルランガ大と共同で、２００５年から０９年にかけて３回、インドネシアの延べ１４州で、無作為に選んだ７０２匹の豚の鼻汁や血液、ふんなどを調べた。 ０５〜０７年に調べた豚の７．４％から高病原性鳥インフルのウイルスが分離され、分析すると、どの豚も近隣の鶏で流行した鳥インフルに感染していた。詳細に調べた３９のウイルスのうち、一つが人の鼻やのどの細胞にくっつきやすく変異していた。０８〜０９年の調査では過去に感染していた形跡はあったが、ウイルスは分離されなかった。
3000年に1度しか咲かない伝説の花「優曇華」―江西 (2010年3月4日) - エキサイトニュース
中国江西省九江市〓山区の民家で2月27日、3000年に1度しか咲かないと言われる伝説の花「優曇華（うどんげ）」が発見された。<br><br>【関連写真】<br>・<a href="http://news.searchina.ne.jp/disp.cgi?y=2009&d=0211&f=national_0211_005.shtml&pt=large" target="_blank">世界でも珍しい植物「金花茶」が開花－広西</a>（2009/02/11）<br>・<a href="http://news.searchina.ne.jp/disp.cgi?y=2009&d=0329&f=national_0329_015.shtml&pt=large" target="_blank">お坊さんびっくり！“男の根”発見－福建</a>（2009/03/29）<br>・<a href="http:
「普通のネズミより10倍長寿」のハダカデバネズミ：その理由は？ | WIRED VISION
前の記事 巨大倉庫で働く「自律型ネットワーク・ロボット」(動画) 「普通のネズミより10倍長寿」のハダカデバネズミ：その理由は？ 2009年3月11日 Brandon Keim ハダカデバネズミ。動画は(2)で紹介 世界で最も寿命の長いげっ歯目とされるハダカデバネズミ。このネズミの持つ飛びぬけて頑丈なタンパク質が、老化の謎を解く重要なカギとなるかもしれない。 ハダカデバネズミが研究者たちの関心を引いているのは、彼らが30年近く生きられるためだ。実験用マウスと体の大きさはほぼ同じであるにもかかわらず、寿命はマウスの10倍近くも長いことになる。[実験用マウスの寿命は最長で3.5年とされるが、理化学研究所には37年生きているハダカデバネズミ(女王)が存在する。 ハダカデバネズミは、アフリカに生息するネズミの仲間。地中に平均80頭、最大300頭もの大規模な群れを形成し生活する。哺乳類には珍しい真社
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植物状態の人にも意識がある：脳波解析で明らかに
自然界にない塩基対を加えた人工DNA、生体内での複製に成功