SC14 - Top500に見るスパコン界の状況
スパコンの新設はスローダウンしている 恒例であるが、SC14で第44回のTop500の「BoF(Birds of a Feather:同じ羽を持つ鳥の集まり、転じて同好の士の集まり)」が開催された。今年1月に、Top500の創始者の1人であるHans Meuer教授が亡くなったので、委員会のメンバーはご子息のMartin Meuer氏に交代している。 Top500 BoF(Birds of a Feather)。右から、Horst Simon、Eric Strohmaier、Jack Dongarra、Samuel Williams、Mike Heroux、Martin Meuerの各氏 なお、Samuel Williams氏はHPGMG、Mike Heroux氏はHPCGという新しいベンチマークプログラムの説明のための参加であり、Top500委員会のメンバーではない。 Top500という
【配信講義】 CMSI計算科学技術特論Ｂ — 日本語
【開催要項】 開催日 ： 2014年の下記日程 （木曜：13:00～14:30） 開催場所： CMSI教育拠点 （下記の開催拠点一覧をご参照ください） ※最寄りの各拠点にてご参加いただくことが可能です。 ※講義内容により参加する回を自由に選択することが可能です。 ※事前に参加登録をお願いします。事前登録のない会場は当日開講しませんので、ご注意ください。 ＜参加申込＞ ※ 開催日前日15時までにお申込ください。 【開催趣旨】 本講義は、物性物理、分子科学、材料科学などに関連する科学技術計算ソフトウエアの開発ができる人材の育成を目的としています。講義は、開発に必要な要素技術、ソフトウエア性能の最適化手法を実施した後、フーリエ変換、オーダーＮ法、ＭＤ、量子科学計算の高度な並列化手法をとり上げます。また、GPUやMICを利用した並列化手法の講義も実施します。どの講義も科学技術計算に共通する要素を
スパコン最大の学会「SC13」に見る先端技術(9) Top500にみるスパコンの方向性(前編)
既報のように、Top500の1位は前回に続いて中国の天河2号で、1位から5位までが前回と同じという結果になった。しかし、6位にスイスのPiz Daintが入り、ヨーロッパ第1位として表彰された。 Piz DaintはCrayのXC30スパコンで、CPUにはXeon E5-2670を使い、アクセラレータとしてNVIDIAのK20xを搭載している。その点では市販のスパコンであるが、ピーク演算性能が7.79PFlopsであるのにLINPACK 6.27PFlopsとピーク性能の80.5%を達成している。これはGPUを主体としたシステムとしては非常に高い性能比率である。その結果、2.325MWの消費電力で2697MFlops/Wと、上位のTop50スパコンの中では最も電力効率の高いシステムである。 Top500スパコンの方向性 Top500システムの国別のシェアとしては、米国が53%と約半分を占め
スパコン最大の学会「SC13」に見る先端技術(11) SC13 - Green500と電力測定の問題(前編)
Top500はHPL(High Performance LINPACK)というプログラムの実行性能(Flops値)でスパコンのランキングを行うものであるが、Green500は、HPLを実行しているときの消費電力でFlops値を割ったFlops/Wというエネルギー効率でスパコンのランキングを行う。ただし、Green500リストに入れてもらうには、あまり小さいコンピュータではダメで、Top500の500位のシステムと同等以上の性能を持つことが要件になっている。 Top500はスパコンの性能向上を後押しするランキングであるが、Green500はエネルギー効率の高いスパコンの開発を後押しするランキングである。 今回のGreen500では、TUSBAME-KFCが1位を獲得 SC13でのGreen500 BoF(Birds of a Feather:同類の集まりの意味)において、Green500の主
東工大の松岡教授に聞いた「TSUBAME3.0」、そしてエクサへの道(後編)
エクサへの道であるが、NVIDIAのGPUのようなアクセラレータを日本が開発するのは容易ではない。NVIDIAはハードウェアだけでなく、CUDAやCUDAライブラリの開発に大きなリソースをつぎ込んでおり、これをキャッチアップすることは難しい。 IntelのXeon Phiのようなメニーコアチップを作るのも、京コンピュータに使ったSPARC64の低電力小規模コアはなく、やるとすればARMを使うしかない。そうなると、高性能のSPARC64コアとのヘテロ構成ではプロセサの命令が違うことになってしまう。従って、Xeon Phiを追いかける道も現実的ではない。 しかし、日本には第3の道があると松岡教授は説く。 東工大はGPUスパコンのハードで先端を走るだけでなく、青木教授らを中心とするアプリケーションのチームと、松岡教授を中心とするソフトウェアグループの層が厚く、かつ共同研究でお互いに深く連携してい
GTC Japan 2013 - OpenACCの理想と現実
NVIDIAが7月30日に開催した「GTC Japan 2013」において、東京工業大学(東工大)松岡研究室の星野氏が、「OpenACCの理想と現実」と題する発表を行った。その前のコンパイラ各社の発表は、半分程度の入りであったが、この発表では会場が満員になる盛況で関心の高さがうかがえた。 GPUのプログラミング用にNVIDIAはCUDAを提供しているが、これは、プログラムをCPUで実行する部分とGPUで実行する部分に分け、処理するデータをCPUのメモリからGPUのメモリに転送し、結果は逆にGPUのメモリからCPUのメモリに転送するなどの処理を明示的に書く必要があり、なかなか敷居が高い。 これに対して、ソースプログラムの中に、ここからここまではGPUで実行する部分と指定すると、自動的にプログラムの分割やデータの転送をやってくれるという仕様がOpenACCである。 現在、CとFORTRAN対応
理研次世代スパコンには二種類の四倍精度が入っている。 - 中田真秀(なかたまほ)のブログ
(4/23 19:35大幅加筆修正) 次世代スパコンは二種類の4倍長精度演算をサポート：IEEE754R及びdouble-double形式。 多倍長精度計算に興味を持っている人間としてはうれしい限りである。 藤澤さん経由で次世代スパコンのページを見た。横川さんのプレゼンのp.10が私にとって興味深い。 > プログラム言語，コンパイラ > Fortran 2003，XPFortran，C，C++ > GNU C/C++拡張仕様 > 4倍長精度演算をサポート：IEEE754R及びdouble-double形式 double-doubleは富士通やIBMのコンパイラは昔からサポートしていたと聞いたことがある。しかし富士通のは、情報しらないのよね... IEEE 754RはIEEE 754 2008が発効された現在、言葉としてあまり良くわからない。多分binary128のことなんだろうか。Spar
［配信講義］ CMSI計算科学技術特論A — 日本語
京コンピューターを中心としたネットワークインフラが整備され、日本各地に設置されているスーパーコンピューターを容易に使える環境が整いつつある。それを活用して大規模で高性能なシミュレーションを実行し、科学の進展のみならず、防災やものづくり、創薬といった社会の安全や産業、医療に貢献していくことが願われている。そのためには、そのようなシミュレーションソフトウエアを開発する人材を育成することが必要である。本講義では、新物質開発やエネルギー創製に関する分野に関係が深い科学技術計算ソフトウエアの開発で、物性物理、分子科学、材料科学などの研究に使われているものの開発に必要な要素技術を中心に取り上げる。 【開催要項】 開催日： 平成25年の下記日程 （木曜：13:00～14:30） 開催場所： CMSI教育拠点 東北大学、東京大学物性研究所、東京大学(本郷キャンパス)、金沢大学、豊橋技術科学大学 総合研究
技術情報 | HPCシステムズはすべての研究開発者に計算力を提供します。
各種化学アプリケーションのNVIDIA GPUベンチマーク QC/MD GPU-Accelerated Applications (2023年9月：NVIDIA社提供)(PDF：2.2MB) NEW! NVIDIA HPC アプリケーション性能 NEW! NVIDIA H100とGeforce RTX4090 性能評価 NVIDIA H100、Geforce RTX4090 機械学習ベンチマーク NEW! NVIDIA® RTX A5000とNVIDIA® A10 性能評価 RTX A5000、NVIDIA A10 機械学習ベンチマーク NVIDIA® RTX A6000 性能評価 NVIDIA RTX A6000 機械学習ベンチマーク NVIDIA® A100 シリーズ 性能評価 NVIDIA® A100 VASP 6 ベンチマーク結果 (2022年7月：NVIDIA社提供) (PDF：
./note040.html
39. ベンチマークの考え方 (2006/12/14) さて、ベンチマークです。計算機アーキテクチャに対してなんらかの方法で定 量的な評価をしながら作るとすれば、結局それはベンチマークをするというこ とです。 問題は、ではどうやってベンチマークを選び、どうやって測定するか、という ことです。どういう方法が正しいか、というのは良くわからないので、まず現 在どういう方法がやられていて、どういう問題があるか、というのを考えてみ ましょう。 ここ15年ほどの間、複数の計算機アーキテクチャ間の比較に使われる標準的な ベンチマークというと spec でした。これは、 なんらかの意味で「代表的」あるいは「標準的」なアプリケーションを 10 個くらい選ぶ それらはソースプログラムレベルで固定で、コンパイルオプションくらいは 変えてよい (アプリケーション毎に変えるか、全アプリケーション共通かの 選択肢あり
Richard Feynman and The Connection Machine - The Long Now
Membership: Dashboard Membership Dashboard Members get a snapshot view of new Long Now content with easy access to all their member benefits. Newsletters Membership Newsletters Published monthly, the member newsletter gives in-depth and behind the scenes updates on Long Now's projects. Clock Blog Clock Blog for Members Special updates on the 10,000 Year Clock project are posted on the members only
./note116.html 「京」でのプログラム最適化
115. 「京」でのプログラム最適化 石山君・似鳥君の宇宙論的 N 体計算用 TreePM コードは「京」で 53%(だっけ)と いう驚異的な実行効率をだしたわけですが、これは2008年には天文台の Cray XT4 で 2048 コアまで十分スケールするプログラムを開発済であった石山君と、 重力計算カーネルの部分で理論的に可能な性能の 97% という効率を引き出す ことに成功した似鳥君の才能と努力によるものです。 普通のプログラムを普通に「京」で実行した時の効率は、典型的には 1-2% で あるようです。これは、大雑把には以下のように理解できます。 「京」の B/F は 0.5 であり、そこそこ複雑な積分スキームの流体コード等 で理想的にチューニングができた時の実行効率が 10-20% である。 SIMD ユニット2つを有効利用できていないと、これは 1/4 程度に落ちる 最内ループに条
"動く(生きた)"状態で飼われるコンピュータたち -東大のコンピュータ動物園
コンピュータアーキテクチャ研究の一環として古い動体コンピュータを収集 東京大学(東大)大学院 情報理工学研究科の平木敬 教授の研究室が「コンピュータ動物園(Computer Zoo)」を運営している。古い、動かないコンピュータを展示するコンピュータ博物館は、あちこちにあるが、平木研究室のComputer Zooはコンピュータを動く、生きた状態で飼うという点が大きく異なる。 平木先生の研究分野は「超高速計算システム・アーキテクチャ」で、計算・通信の高速化をハード、OS、コンパイラの視点から実現することが研究テーマである。このComputer Zooも過去のコンピュータの性能や消費電力のデータを取るというアーキテクチャ研究の一環である。 古いコンピュータの性能測定データは公表されたものもあるが、測定条件がまちまちであるし、消費電力が大きな問題になる以前の時代のコンピュータでは、電力のデータが無
SC12 - ハイブリッドスパコンが増加したTop500
2012年11月に米国ソルトレークシティー(Salt Lake City)で開催された「SC12」というスーパーコンピュータ(スパコン)最大の学会/展示会で、第40回のTop500リストが発表された。今年のTop10のスパコンを並べると、以下の表のようになる。 今回1位に輝いたのは、米国のオークリッジ国立研究所(Oak Ridge National Laboratory:ORNL)に設置されたTitanというスパコンである。ハードウェアはCrayのXK7スパコンであり、CPUとして16コアのOpteron 6274を使い、NVIDIAのK20Xをアクセラレータとして使うハイブリッドスパコンである。そして、Opteron 6274 とK20Xのペアからなる計算ノードを16,688ノード持ち、それらをCrayのGeminiインタコネクトで接続している。これら全体の総コア数は560,640コアで
114.2012年ゴードンベル賞
114. 2012年ゴードンベル賞 今年度のゴードンベル賞は石山君、似鳥君と、一応牧野も共著者にはいってい る、「京」全体を使った宇宙論的 N 体計算で 5.67PF (10月の最終アップデー ト後)を達成したという論文に与えられました。 私は口をだすとか論文に赤をいれるとかフルノード実行の時間作ってと 連携推進会議でお願いするとかくらいしかしてないので、これは基本的に 全て石山君と似鳥君の成果です。 「京」でここまでの性能を達成したのは本当に素晴らしいことです。 今回はファイナリストに5グループ残っていて、実行性能では BG/Q フルシステ ム(セコイア)を使った2グループが 11 PF や 14PF を達成しています。14PF の ほうはアルゴンヌのグループで、やっていることはこちらと全く同じ大規模な 宇宙論的N体計算、アルゴリズムも基本的に tree と PM の組合せです。 が、石
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