遺伝統計学の基礎 Rによる遺伝因子解析・遺伝子機能解析 | Ohmsha
はじめに 第1部 遺伝子型から表現型まで 第1章 遺伝――似ていることと似ていないこと 第2章 DNA、RNA、タンパク質、形質 第3章 多様性の諸相 第2部 データ、サンプル、サンプルの集まり 第4章 観察して評価すること 第5章 サンプルを個別に捉える 第6章 サンプルを集団として捉える 第3部 サンプルの集まりの特徴づけ 第7章 尺度、変数、自由度、次元 第8章 分 布 第9章 確率と尤度 第10章 連鎖解析に見る尤度と変数 第11章 指数（インデックス）とは 第4部 推定、仮説、棄却、関連、因果 第12章 推 定 第13章 棄却と検定 第14章 関係と因果 第5部 大規模なこと 第15章 数え上げる 第16章 省略する 第17章 たくさんの検定 付 録 付録A R 付録B 数式記号 はじめに 第1部 遺伝子型から表現型まで 第1章 遺伝――似ていることと似ていないこと 1.1 形質
生命情報解析研究室
新着情報 新しい発現変動解析手法MBCdeg3の論文(Makino et al., 2023)が公開されました。MBCdeg2(Osabe et al., 2021)の改良版という位置づけですが、大幅な性能向上を達成しています。(2023/12/15) 改訂版RNA-Seqデータ解析 WETラボのための超鉄板レシピ(坊農秀雅 編)が刊行されました。Chapter 5を担当させていただき、Web資料を丸々作り替えました。(2023/09/28) 日本乳酸菌学会誌の2023年7月号に、NGS連載第21回(シミュレーションデータの生成)が公開されました。(2023/07) Web連携テキスト バイオインフォマティクスのページの読み込みに時間がかかっていた問題を大幅に改善しました。(2023/05/24) 2023年度のアグリバイオインフォマティクス教育研究プログラムの外部生受講申し込み期間は5月
R/Bioconductor で BAC アレイ解析をしてみた - 気の向くままに
疾患と染色体構造異常の研究においてもデータの相互比較は重要だと考えています。 しかし実際どうすれば出来るのかという情報がなさそうだったので、自前で公開してみます。 つーことでこんなのあるよ、という情報は全力でお待ちしております。 # まだ少しづつ手を加えると思います。 http://d.hatena.ne.jp/ma_ko/20090204/p1 の実践編です。 目的 自分の研究に用いている染色体の構造異常解析という手法があります。 今回は自分のデータと過去に論文として報告されているデータとの比較解析が出来る環境を整備することが目的です。 背景 自分の実験データの中で、過去に論文としてしっかりと報告されていない染色体領域に注目することが最近ありました。 これは後述する染色体構造異常データベース DECIPHER と自分のデータを比較することで明らかにできたものです*1。 しかし DECIP
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