トポロジーを使ったタンパク質構造分析 - Qiitaこちらは創薬アドベントカレンダー2018 の21日目の記事です。 タンパク質の幾何学的なモデルであるファットグラフモデルについての簡単な紹介を書きました。数学的に厳密なstatementは省略していますので、気になった方はぜひお声掛けくださいませ。お話に伺わせてください！ 目次 はじめに 解きたい課題 トポロジーとは タンパク質のファットグラフモデル はじめに はじめまして。根上 春と申します。 学部では構造生物学を専攻し、 修士課程では分子グラフと機械学習の創薬への応用を研究し 博士課程ではファットグラフと呼ばれる特殊なグラフを使ったタンパク質の立体構造分析手法の研究をしております。 分子グラフについては今年の創薬アドベントカレンダーの14日目に @mojaieさんが解説してくださっていますのでそちらをどうぞご覧くださいませ。 使用言語は日本語、英語、Python、シェルスクリプト。エデ
