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Bioinformaticsに関するT-norfのブックマーク (2)

肝臓がん遺伝子で6分類　個々に効く薬の開発期待　国立がん研などゲノム解読 - 日本経済新聞
日本人の肝臓がんは、原因となった遺伝子によって6つのタイプに分類できることを、国立がん研究センター、理化学研究所、東京大学などがつきとめた。300人の肝臓がんのゲノム（全遺伝情報）の解読でわかった。将来、タイプごとに効く薬の創薬や、既存の抗がん剤の効き方を予測する技術の開発につながるとみられる。12日に、米科学誌ネイチャージェネティクスに発表する。細胞は日々分裂を繰り返しているが、その際、ま
T-norf 2016/04/12
バイナリで約18TBぐらいになりそうだけど７０兆塩基読んで、３００人分の肝がん細胞の全ゲノム配列を特定。結果６タイプに分類。この知見あれば病理医いらんのじゃないかな

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富士通研、ゲノム解析を400倍高速化 - 日本経済新聞
富士通研究所は、ゲノムの変異情報と環境情報の関連性を調べるデータベース上での解析において、従来手法よりも約400倍高速に処理できる技術を開発した。ゲノム情報に基づく医療を効果的に実施する上では、「バリアント」と呼ばれる変異箇所のゲノム情報や、臨床・環境情報の関連性を大規模に集めて統計的に解析することが欠かせない。その手法としてはゲノムワイド関連解析（GWAS）が用いられるが、膨大な量のデータ
T-norf 2016/03/16
バイナリーで扱うのは当然として、ここでいう固定長ビットのバリアントってなんだろ。遺伝子毎にってことかな。

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