コマンドラインで git config --global core.autocrlf false とするか、 git config --global core.autocrlf input としてみましょう。設定ファイルをいじるならC:\Users\ユーザ名\.gitconfigファイルの autocrlf = true の所をinputかfalseに変えても直ると思います。 Inputとfalse、trueの違い trueは、チェックアウトするときはLFをCRLFに変換します。コミットする時はCRLFをLFに変換します。 inputは、チェックアウトするときには変換しませんがコミットする時はCRLFをLFに変換します。 falseは変換しません。 チェックアウトのところはクローンしても同じです。